从鹿子镇出发，一路经过三曜市、梦之遗址以及七宝市，在拿到了前两个道馆的徽章之后，会顺着剧情来到大城市飞云市。在飞云市解决掉等离子队的麻烦并击败道馆馆主亚堤拿到甲壳徽章后，会接到前往下一个城市雷文市的任务。离开飞云市向北走会进入一段漫长的沙漠地带，也就是4号道路。在这条沙尘漫天的道路上再次遇到劲敌切伦，他会主动找玩家进行一场对战。
击败切伦并准备继续前进时，剧情的核心人物之一红豆杉博士会出现在道路上。在一段简单的对话之后，博士会为了奖励玩家的进步直接将秘传学习器02飞翔赠送给玩家。拿到飞翔之后需要完成雷文市的道馆挑战，在雷文市的游乐园深处才能找到电系道馆的馆主小菊儿。这个道馆的解谜机制是乘坐过山车切换轨道，需要一边和里面的训练家对战一边寻找通往终点的路。最终见到小菊儿并战胜她的电蜘蛛和两只导电飞鼠就能获得伏特徽章。只有拿到了这枚徽章，系统才会解锁飞翔在地图上的使用权限。
在合众地区能够学习飞翔的宝可梦种类非常丰富，最容易入手的宝可梦是在4号道路或沙漠奈何桥附近随处可见的黑眼鳄或者豆豆鸽。尤其是豆豆鸽在进化成波波鸽和高傲雉鸡后是前期非常靠谱的飞翔交通工具，如果在沙漠里抓到了象征鸟或者秃鹰丫头以及勇士雄鹰，它们也都是学习飞翔的绝佳选择。
