杂交版最大的特点就是融合，这个融合会出现在植物和僵尸身上，玩家可以看到之前各种植物的元素融合到同一个植物上，僵尸的模型也有了巨大的变化。塔防最基本的玩法是没有变化，但植物的杂交系统是这个版本最灵魂的地方，用经典的植物为基础，用两个甚至多个植物进行杂交融合，可以得到全新的植物系统，每个经过融合的植物能力、外形都会变化。比如豌豆向日葵，就结合了豌豆和向日葵的特性，可以一边产出阳光一边进行攻击。
杂交植物将多个功能进行了复合，让一个植物拥有多种能力，可以很大程度减少带植物卡槽的压力，能带的植物品类更加多，战斗的内容也会更加丰富。除了植物僵尸也进行了杂交，僵尸之间的一些机制也会融合，在强度和机制上会变得更加复杂多变，几乎每个关卡都要进行一次变阵，僵尸的品种也得到了升级，高强度的进攻挑战不是原版的植物可以应对的。关卡中的环境也能更加丰富，除了原版的草坪、泳池和屋顶，还增加了森林、都市等环境，创意模式中的关卡会更加的有趣。
更有非常新奇的盲盒玩法，消耗阳光可以打开盲盒，里面会随机出现僵尸或者植物，每一次的盲盒开启都是一次博弈，很考验玩家的运气。杂交版对于原版来说趣味性更足，能看到很多没有见过的植物和僵尸，你永远不知道下一个你得到的植物有什么功能，这种不确定性带有一种刺激感。还可以根据这些融合植物开发不同的阵型，战斗节奏不再休闲，而是换成了压力比较大的对抗形式，玩法不再很千篇一律，论内容的丰富度要强很多。
