进入应天府地图之后会在城市的左上角区域看到一座巨大的木架，这个就是琉璃塔。刚进入应天府时对应的地块还处于迷雾之中，这时候大报恩寺琉璃宝塔是不能进行操作的。想要开始建造大报恩寺琉璃宝塔，必须先点击该区域边缘的官道或者告示牌，消耗一定数量的铜钱和体力进行地块探索。在驱散地块迷雾之后，这座大报恩寺琉璃宝塔才会允许玩家进行交互。在开始建造大报恩寺琉璃宝塔之前，玩家需要确定应天府的等级已经达到了基本要求，并且拥有足够多的闲置劳动力，这种建筑对于工人的需求量是非常大的。
第一阶段的建造任务比较简单，点击宝塔雏形后会弹出升级界面，一级琉璃宝塔的修缮需要准备好一千铜钱和一千份食物。这个阶段的施工周期只有一个小时，而且是初期工程，只需要派出三名普通的居民去干活就可以了。如果这时候玩家手上有建筑属性比较高的特殊居民，尤其是文徵明或者吴黎，可以将他们派为负责人，他们拥有缩短建造时间的能力，能够让第一层的完工速度提升很多。
当第一层琉璃塔建好后就可以开始进行第二层的升级，这时候需要的资源种类开始变多，不仅需要基础的三千铜板和五百份食物，还需要额外提供一千个木板。木板需要在应天府的林场产出原木后，再通过锯木厂进行加工获得。这一层的建造时间会增加到两个小时，同时需要投入四名工人。在这个阶段要保证仓库里的食物储备充足，这时候所有的生产设施基本都是处于工作状态，食物消耗会非常快。琉璃塔一共有九层，后面的每一层修缮不仅需要消耗更多的铜钱和食物，还需要更多的工人和一些特殊的稀有材料，不过满级后的琉璃塔能为全地图的建筑提供大量的环境值加成。
