打中级锦标赛需要先通关初级锦标赛，之后才能去挑战难度更高的中级锦标赛。挑战之前要准备好三套卡组，因为整个赛程需要完成三个赛区的挑战。并且每张卡牌只能参与一个赛区的战斗，不能重复去参赛。进入猎人锦标赛后，可以看到中级有环珑、新港和万恒三个赛区。每个赛区都有四场战斗需要完成，相同赛区的每场战斗只能用同一套卡组。在中级锦标赛开始之前就要选定好卡组，并把卡组分配给每个赛区。
同时玩家能够看到每个赛区每场战斗的敌人有哪些，以及敌人的星谱是什么颜色。每个赛区的第一场战斗中，敌人都是40级，之后每场战斗敌人的等级都会增加5级。每个赛区的最后一场战斗要面对55级的敌人，要是卡组的实力太弱就无法打过。每个赛区的星谱也都是固定的，环珑赛区为黄绿，新港赛区为蓝红，万恒赛区为紫粉。为了能够在中级锦标赛中获得优势，玩家所需的卡组星谱最好能够克制敌人的星谱。利用星谱之间的克制关系能够让主角的实力提高，降低卡组等级不够带来的劣势。
中级锦标赛总共有12场战斗需要完成，全部打赢后就能通关中级锦标赛，后面能够继续参加高级锦标赛。每场战斗还有星级要求，拿到三星才能得到全部的勋章奖励。结束战斗时本关剩余的时间越长，拿到三星的可能越高。想要三星需要关卡的剩余时间超过90秒，因此挑战时还要考虑通关速度。
