二周目时走到过道尽头并打开最里面的门，进入房间后可以在大门内侧正上方看到一个蓝色符石。拿起符石后可以尝试把石饼放到房间内的装置上，没反应的话就回村庄找小男孩，顺便看他的种子有没有长成一棵大树。看到大树后点击大树身上的箭头，再点开飞船门就能够成功回到飞船内部了。遇到密码门后需要输入前面在工厂研究室的墙上看到的密码，先点开中心一排第二个和第五个灯，再点开另外两排中间的灯。
密码输入不正确的话可以回工厂再看一遍密码提示，每个存档的密码并不是完全一样的。进入飞船后会发现一个放能量的地方，再上二楼把箭头道具放到玻璃罩下方，这时角色会拿到玻璃罩里面的花朵标本。二周目会在花盆边刷一块蓝色符石，看到的话记得把符石收起来。氧气罐里面有个昏迷的人，解开小游戏的谜题后就能够把他救出来，要注意的是移动方块时只能从方块的两个边拉动它的位置。解救完毕并与之对话后会得知飞船已经没有能量了，接下来需要回到工厂找鲁特琴。
路上遇到壁画时注意记一下道具和符号的对应顺序，后面需要根据木桩上的符号放置对应的道具。二周目的时候把红眼睛放到墙上会得到一组动作，记下动作顺序后回到以前的神庙里。一周目的时候飞船是飞不出去的，只有完成二周目的相关任务才能让飞船冲出章鱼的包围圈。回到房间内部后把金色石饼放到装置上，墙上会出现一些只有半边的石板，根据研究室墙上的信息把对应的物品放上去。解开密码后会拿到一个能量块，这时再回到飞船处就能给飞船补充能量了。
