当主城被敌军或者野怪打爆之后，主城内部的所有建筑以及指挥中心等都会连带出现严重的损毁。一旦主城的生命值降低到0时，系统就会自动开启故障保护机制，这样就可以前往新的地点重新建立基地。重新建立基地需要用掉大量的建造资源，这些资源包括金属以及各类燃料等，所以想要快速完成基地的建造，就必须将这些建造材料集齐。完成基地的重新建造之后，第一时间需要将防御建筑的等级拉满，这样做主要是为了防止基地被二次摧毁。
原来的主城一旦被敌人打爆，就意味着直接失去了对周边所有资源的控制权，所以只能派遣舰队去往其他的区域寻找建造基地的资源。而在主城遭遇敌人袭击的过程中，大多数的舰船都会遭到不同程度的损毁，此时就需要尽可能保存能够继续行动的战舰，并将可利用的燃料以及弹药一起带走。
破损程度较轻的战舰最好一同带上，虽然这些战舰的战斗力大幅下降，但是在经过后续的修复之后同样可以继续出战。如果在主城被摧毁之前已经加入到一个联盟中，就可以寻求其他联盟成员的援助。并且在重新建造基地的过程中，可以与联盟成员的支援战队去掠夺敌军的资源。如果顺利将敌军的资源点占领下来的话，立即派遣人员进行合金以及其他能源的采集，这样就可以大大提高新基地的建造效率。
