穴居隐疾虫属于一种孵化而来的罕见生物亚种，消耗掉一只普通隐疾虫就可以在孵化器中将其孵化出来。这里就需要先捕获到一只纯种隐疾虫，在抓捕之前需要先购买到麻醉步枪以及专用诱饵等必备材料。将火卫二地图的所有平原声望都刷完后，就可以找到罗斯并与其进行交互，过完对话之后点一下在屏幕中出现的浏览商店选项。点进去之后一直往下拉，就可以找到在此处出售的麻醉步枪，花掉五百声望点就可以将麻醉步枪买到手。
使用麻醉步枪射出的麻醉针就可以将命中的隐疾虫麻醉至镇定态，所需声望点可以从地球或者木星的间谍任务奖励中刷到。买完麻醉步枪后顺带将回声诱饵以及腺体买一下，回声诱饵与腺体搭配在一起就可以将隐疾虫从目标区域中引出来的。随后将刚刚买到的麻醉步枪拖动到装备栏任意空出来的槽位内，并将当前所在星球切换成金星，这样就可以直接传送到高概率刷出这种动物的夜魔胎之镜，只有魔胎之境中有高概率会以自然生成形式刷出隐疾虫。当角色到达目标地区后先把大地图按出来，在地图右下方会显示出起始时间以及截止时间，而隐疾虫只有可能在这段时间内出没。
此阶段就可以看到地图中显示有紫色的昆虫图标，这里就需要对标注有昆虫图标的点位标记一下。高速移动到目标区域后操控其行进到标记好的位置，紧接着在魔胎之境就可以找到隐疾虫留下的有有粪便以及爪痕。跟随地面上的爪痕一直往前行进，当角色行进到呼叫点之后将装备栏页面按出来，并选择其中的腺体拿出来。使用掉之后立刻把隐疾虫回声诱饵拿出来，拿出回声诱饵后一直按住左键不松开，就可以操控角色来发出与隐疾虫相同的昆虫叫声，隐疾虫听到叫声后必定会被引过来。接下来就可以将麻醉步枪拿在手中，并在瞄准视野下将视角进行水平方向的缓速挪动，直到视野中显示有紫色昆虫图标，就意味着该区域内已经有隐疾虫被引来了。
当昆虫图标缓慢挪动到中间的扇形方框内就可以按一下左键将麻醉针射出去，如果隐疾虫首次被击中后仍然能够缓慢爬动的话，就需要二次点击左键补上第二发麻醉针，直到将其完全被镇定住且放倒在地面上为止。随后控制角色走到隐疾虫倒下的地点，对着其按下X键就可以自动开启动物抓捕流程。此时在屏幕左上方可以看到一段初始为空心的进度条，一旦开启抓捕空心条就会被黄色的进度条以固定速率填充。当黄色进度条集满之后，就可以顺利将角色身前的纯种隐疾虫抓到手。最后返回到飞船内的孵化器那里，进入到孵化器的操作页面放入普通隐疾虫以及穴居基因编码模版，然后就能在完整的孵化流程结束后转变成一只穴居隐疾虫。
