副将科技是在等级达到120级之后挑战曹真,将其打败之后得到的。玩家想要对其进行研究就必须先取得,取得之后进行研究,在原有的配将位置里开启额外的第五个武将席位,它就是副将位,玩家可以在酒馆里对该位置的武将进行招募。可招募的范围与之前一样,包含玩家挑战过解锁的所有武将,每次重新进行招募时可以对其进行更换。

副将虽然也是武将,但其有着主将所拥有的大部分待遇。只是必须要在所有武将里选择一个作为副将的带领武将,被选定的武将战斗时会有五排兵,比起原本的兵力多上一层,固定最后一排为副将部队,其可以释放战法,但对于兵力同样存在要求,只有兵力满时可以释放。其他的装备、宝物和招募兵以及进度条这些内容全都和主将进行区别,副将的所有内容都需要玩家像单独武将一样进行搭配,独立计算,只有加速募兵的时间是双方一样的,加速时要进行双人兵力数量的募兵令消耗。

副将科技所解锁的第五个武将槽位也并非永久的,因为它始终要捆绑在主将的身上,但后续玩家将等级提升到150级,这时的玩家可以解锁珍宝系统,并执行第五个珍宝的修复任务,只要在丝绸之路集齐珍宝碎片,将其修复完好,第五个武将槽就会彻底解锁。从这时起,副将科技得到提升,该位置的武将无需作为副将,可以独立成为第五名武将。