晨岛的隐藏洞穴有两处，但入口藏得比较隐蔽，第一次跑图的话很容易直接从旁边走过去。第一个洞穴在海边沙地的山丘下面，从刚进晨岛的光线大门出来，往正前方的沙滩方向走，穿过第一段狭窄的石缝通道后，会看到一大片开阔的沙地。这时不要直着往神庙飞，而是往左手边的海岸线靠过去，贴着海水走几步就能看到一座低矮的山丘。山丘的正面朝着大海的那一侧有个半人高的洞口，洞口周围长着几棵枯草，不注意看会以为只是石头缝。站到洞口边缘会发现里面黑漆漆的，洞口上方有几只蝴蝶在绕圈。
长按身体让蝴蝶带着飞起来，对准洞口中间轻轻推方向就能滑进去。要是一头撞在石壁上就退后两步重新调整角度，多试两次就进去了。这个洞穴不需要任何前置条件，刚进晨岛的第一天就可以直接打开。洞里面不算大，正中间的地面上放着一个光之翼，捡起来就能拿到。洞壁四周还散落着几盏小蜡烛，全部点亮之后能收集到一小堆烛火，跑图路过的时候顺手收掉不亏。第二个隐藏洞穴在神庙大门外面的左侧，想要进去得先把晨岛的主线走完，也就是收集到指路和跟上这两个动作。
指路动作藏在晨岛第一个大洞穴右侧的岔路深处，跟上一个平台上的发光蓝点就能拿到。跟上动作在飞行平台的下面，跳下去之后往左拐，穿过一条窄缝就能看见。把这两个动作都拿到手之后，飞到晨岛终点那座大石门的外面，面对石门往左手边的山体看过去，能发现一个被碎石挡住的洞穴入口，屏障已经自己碎掉了。走进去是一个圆形的石室，正中间的石台上摆着拒绝动作的光点，摸一下就能学会。石室的地面上还有几堆烛火可以收集，全部收完就完成了这个洞穴的探索。
