在完成系列任务澎湃狂潮后，会解锁航道星舰，也可以在商店直接购买入门航道星舰组合包，购买后澎湃狂潮系列任务自动完成。获得飞船后，首先前往氏族道场，按住Q快速移动到干船坞。来到旁边的研究操纵台，萌新一开始就可以在这里直接制造三级部件。MK后面就是部件的等级，把第谷追踪弹、反应堆、引擎、护盾、装甲各制造一个三级，还可以随便搞两个三级炮台，比如毒液穿甲炮。说是制造其实相当于兑换，点了制造马上就能获得，这些制造材料都可以在九重天获得。
然后来到配置航道星舰的操作台，可以装上这些部件。使用带有前缀为L、V、Z的部件，这种部件是在任务中掉落的，比刚才制作的要好一点。炮台指的是左键射击，第谷追踪弹指的是鼠标中键射击。第谷追踪弹就是在氏族制造的，任务中没有掉落。要装备任务中掉落的部件，需要点击检视查看属性。然后点击修复，选择右下角的捐献全部，点确定。修复需要十二个小时，修复后的部件可以通过融合残骸来获得属性提升。
选择部件，选择效价融合，只能选择前缀一致的部件进行融合。比如Z装甲只能选Z装甲融合，属性提升存在上限，当融合无法提升时会提示移到最大值。不同的前缀侧重点不一样，比如L装甲血高，护甲低，而Z装甲血和护甲比较平衡。多余的部件可以在报废已回收的残骸处分解，能分解成内融核心，所以九重天刷豆子也是非常不错的。这里选部件的时候，可以用鼠标中键选择，点一下能选择全部。
航道星舰的配卡在干船坞处可以配，也可以在轨道飞行器处进行配卡。这里叫深控，最高等级三十，提供段位经验。可以上光环MOD，火炮指的是鼠标中间发射的炮弹，炮台指的是左键开火，一般在九重天很少会用到左键开火。配卡是飞船的基础MOD，叫综合型。点上方查看战斗型，这里的MOD代表的是飞船的技能，重点是三技能追踪齐射，发射群体追踪弹。轻小飞船非常好用，开飞船时按下三就可以了，有了这个技能就用不到左键开火了。开船使用技能消耗的是战舰的能量，比较推荐使用蛇甲来开船。因为蛇甲放技能人不耗能，只有冷却时间，就可以频繁用追踪齐射来清小飞船。
