洪水关卡出现在剧情中段，当多米格斯博士夺走查克切尔的钥匙后，会被卷入一场突如其来的洪水中。整个脱险过程可以分成四个阶段，每个阶段的应对方式都不一样。洪水逃生的第一阶段是急流冲浪。被卷入洪水后，要立刻用方向键或手柄摇杆控制左右移动，躲避迎面冲来的各种障碍物。尽量保持在主水流的中央位置，两侧的残骸和危险结构更多，靠中间减少碰撞。被洪水冲往下游的过程中，会抓住一扇木窗，这时候要快速按上键向上攀爬。
第二阶段是水下潜水，攀上木窗后会被逼入水下，这时候要找到前方有亮光指引的门口或通道。游动时可以按加速键游得更快，但要时刻关注氧气条的变化，沿途寻找气泡或空气口袋及时换气。找到那扇门后游进去，里面有个红色逃生口的铁门开门出去。出门后朝着亮着车灯的方向游过去，进入车子内部后移动到车尾箱处，用近战攻击键砸开玻璃窗游出去。第三阶段是上岸跑酷，浮出水面后危险还没结束，要继续躲避障碍物，直到被冲到一面墙下。爬上岸后不要停留，沿着路一直向前跑，依次跳到货车顶上、广告牌上。
接着利用路灯杆摆荡到小屋顶上，再借力跳到集装箱上，最后抵达一个石台。第四阶段是外墙攀爬。从石台起跳，跳到房屋的外墙上，迅速往左侧攀爬，跳上木板后转向外墙的凸槽往右一直攀爬。遇到冒火的窗口处要向上爬，最终到达屋顶触发剧情。整个过程中要留意洪水的上涨速度，动作要快避免在水中停留过久被冲走。有些地方可能需要用到绳索箭矢来固定木筏或连接绳柱，遇到被绳索拴住的木筏也可以用火箭烧断。
