根据不同情况来做防守，大本营算得上是整个部落的核心，因为三颗星的判断标准里，拆掉大本营就可以算作一颗星，基本所有玩家想要拿满星就要冲着它而去。所以玩家在进行防守时一般都要将其做为核心保护对象，它也确实有着这些能力，无论是援军的设置还是管理所有建筑等级的基建功能。玩家在进行防守时一般也会将之放置在最安全的位置，要么是中心位置再加以各类防御建筑，要么是在角落用围墙和建筑进行多重防护。
但在有些时候，资源建筑比起大本营要重要得多。尤其是中期左右的时候，玩家每天的资源来源就是去掠夺以及上号之后领取储存罐里的资源，如果没有保护好资源建筑，就很容易出现囤了一天的资源上号后已经所剩无几的情况，对于缺少资源的中期玩家来说很痛苦。所以有些玩家就会将大本营放在稍微靠外的位置，将资源建筑进行分散放置，力争保住所有的资源建筑，完全针对偷资源的玩家。也因为这种建筑的珍贵价值，有些玩家后期就会把资源建筑单拎出去放在城墙外，告诉别人打完资源自己退，以此保护剩下的建筑。
还要保护的就是带有特殊机制的防御建筑，这些防御建筑有时是保住整个部落的关键。从七本开始的飞龙流，这时玩家要做的防守关键就是保住家中所有不多的防空建筑，因为防空建筑一旦被打掉，就代表着飞龙无人反制，其他建筑全部都会被打掉。防御建筑必须要分散放置，尤其是防空建筑的距离必须把控好，其他建筑的放置位置可以相对诱人一些，诱导敌人去攻击而放过防空建筑，就为了保住应对飞龙的最后手段。
